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betway必威作物应用基因组团队在Nature Plants发表论文

    2021-01-16 21:50:26 来源:betway必威          浏览数:0

  近二十年来,可移动small RNA在植物生长发育过程中的调控一直是研究热点,然而迄今为止,只有少数small RNAs 被发现具有移动性,并且能够作为系统性信号(systemic signaling) 在目标部位调控基因的表达。近年来,嫁接实验和高通量测序技术已经应用于全基因组水平的移动mRNA鉴定,但是对于移动mRNAs的完整性及目标组织中的相对丰度还依然不够清楚。

  2021年1月15号,国际著名期刊Nature Plants在线发表了betway必威作物应用基因组团队与美国普渡大学合作完成的题为“Unidirectional movement of small RNAs from shoots to roots in interspecific heterografts” 的研究论文,首次报道了豆类作物small RNAs单向运输的现象。同时Nature Plants刊发了澳大利亚La Trobe 大学Mathew G. Lewsey教授的题为“Small RNAs shoot for the root”推介文章,揭示small RNA才是真正的远程“传令兵”,而不是mRNA。这也是作物应用基因组团队近三年来第二次在Nature Plants期刊发表论文(该团队2018年1月在Nature Plants发表论文:Elevation of soybean seed oil content through selection for seed coat shininess,公司教师李帅博士为共同第一作者,马渐新教授为通讯作者)。
 

 

  该研究团队利用大豆与菜豆异源及自嫁接植株作为实验材料,通过small RNA-seq分析发现:移动的small RNAs 表现为由茎端到根部的单向运输;多数small RNA 表现出不能由根部产生,但在根部高丰度积累。通过降解组测序和5’-RACE实验证明了移动的small RNAs由茎端运输到根部后,能够在后转录水平调控基因在根部的表达。另外,通过 RNA-seq和ONT RNA-seq 技术鉴定了数千个基因的可移动mRNAs,其中一半以上的可移动mRNAs为全长转录本。但是,该研究发现,移动到目标组织中的mRNAs仅占目标组织该总mRNAs中极少的一部分。这一现象与small RNAs的单向运输,在根部积累的现象完全不同。这些结果表明,可移动的small RNAs和mRNAs在功能和运输机制上有很大的不同。
 

 

  图:可移动sRNA和mRNA运输的方向及在受体组织中的表达量。

  (a)miRNA移动和积累模式图;(b)可移动mRNA和sRNA在受体组织中的表达量;Gm为大豆组织。Pv为菜豆组织。

  betway必威教师李帅副教授、美国普渡大学王旭彤研究员为该论文第一作者;betway必威西汉姆联官网硕士研究生徐文英、刘通和蔡春梅副教授,以及美国普渡大学博士研究生陈李洋、Chancelor B. Clark为共同作者;马渐新教授为通讯作者。该课题得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划和美国农业部研究计划的资助,以及山东省高校植物生物技术重点实验室、生科院农业科研仪器平台的支持。

  论文链接:

  Unidirectional movement of small RNAs from shoots to roots in interspecific heterografts. Nature Plants, 2021, 7:50–59, https://doi.org/10.1038/s41477-020-00829-2

  推介论文链接:

  Gouil Q, Lewsey MG. Small RNAs shoot for the root. Nature Plants, 2021, 7, 2–3 https://doi.org/10.1038/s41477-020-00836-3

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